Στις παθήσεις του Μυοσκελετικού Συστήματος, ο Φυσίατρος πραγματοποιεί λεπτομερή κλινική εξέταση προκειμένου να εντοπίσει με ακρίβεια την προέλευση της βλάβης. Λαμβάνει επιπλέον πληροφορίες από τις απεικονιστικές εξετάσεις και οργανώνει τα επιμέρους στοιχεία του κατάλληλου προγράμματος αποκατάστασης, που είναι απόλυτα προσανατολισμένο στην αιτία της πάθησης και την αντιμετώπιση των όποιων περαιτέρω επιπλοκών της. Ανάλογα με την εντόπιση της βλάβης, οι μέθοδοι αποκατάστασης που εφαρμόζονται περιλαμβάνουν τεχνικές για την ανάρρωση /επούλωση του ιστού που πάσχει (μυς, τένοντας, σύνδεσμος, οστό, αρθρικές επιφάνειες). Φαρμακευτική αγωγή, φυσικά μέσα (θερμό, ψυχρό, ηλεκτρισμός), θεραπευτική μάλαξη, συνταγογράφηση ναρθήκων / κηδεμόνων, ελάχιστα επεμβατικές μέθοδοι όπως ο βελονισμός και οι τοπικές εγχύσεις με αναγεννητική δράση και οδηγίες κατάλληλης και προοδευτικής άσκησης, αποτελούν τα επιμέρους στοιχεία του προγράμματος αποκατάστασης.